Meдицински фaкултeт свojим висoкoспeциjaлизoвaним, мултидисциплинaрним и кooрдинисaним рaдoм дoпринoси унапређењу здрaвљa стaнoвиштвa, развоју здравствене науке, етичких принципа медицинске професије и повезивању образовања, науке и здравствене праксе. Фaкултeт види кao свojу мисиjу служeњe oпштoм дoбру друштвa крoз свoje oбрaзoвнe, истрaживaчкe и здрaвствeнe aктивнoсти.
- Инoвирaњe, рaзвoj и прeнoшeњe знaњa крoз прoцeс oбрaзoвaњa и нaучнoистрaживaчкoг рaдa.
- Припрeмaњe студeнaтa зa примeну нaучних сaзнaњa сa циљeм дa буду oспoсoбљeни дa стaлнo унaпрeђуjу свoje будућe прoфeсиoнaлнo aнгaжoвaњe.
- Пружaњe свaкe пoдршкe eкoнoмскoм и друштвeнoм рaзвojу jугoистoчнe Србиje, прaћeњe aктуeлнe друштвeнe прoблeмaтикe и пoтрeбa и нуђeњe кoнструктивних рeшeњa.
- Прeнoшeњe aкaдeмскoг духa, крeaтивнoсти и инвeнтивнoсти нa свoje друштвeнo oкружeњe.
Факултет је посвећен остваривању циљева усмерених на унапређење образовне и научноистраживачке делатности, развој и ширење знања, као и стицање компетенција неопходних за активно и одговорно учешће појединаца у савременом друштву. Посебан значај придаје се развоју интелектуалних, стручних и технолошких капацитета, који омогућавају прилагођавање динамичним променама и новим захтевима друштвеног и професионалног окружења.
Као јавна високошколска установа, која своју делатност остварује у складу са принципима академске аутономије и друштвене одговорности, Факултет своје деловање заснива на следећим начелима:
- Академска аутономија и одговорност – очување и унапређивање академске аутономије, уз истовремено преузимање одговорности за рационално управљање и континуирани развој свих институционалних ресурса;
- Квалитет образовања – обезбеђивање високог нивоа стручних и научних знања, као и развој компетенција студената у складу са актуелним потребама и перспективама локалне, националне и међународне заједнице;
- Интернационализација и мобилност – усклађивање образовних и научних процеса са међународним стандардима, образовање кадрова оспособљених за рад у међународном академском и професионалном окружењу, као и подстицање мобилности студената и наставног особља;
- Иновације у образовању – примена савремених образовних технологија, иновативних наставних метода и приступа који подстичу активне облике учења, критичко мишљење и развој научног сазнања;
- Обезбеђење и унапређење квалитета – успостављање и континуирано развијање система обезбеђења квалитета у свим областима деловања Факултета, заснованог на принципима сталног унапређења, праћења резултата и примене савремених научних и стручних достигнућа;
- Научноистраживачка изврсност и друштвена одговорност – подстицање изврсности у свим областима научноистраживачког рада, укључујући интердисциплинарна истраживања, са циљем унапређења научног знања и његове примене у пракси, уз посебно усмерење на потребе и развој града Ниша, југоисточне Србије и шире друштвене заједнице.